这起陆奥号事件最终在德、美、苏、英、法、意六大国的居中调停下得以“圆满解决”，当然了，所谓的“圆满解决”指的是蒋纬国以及以他为代表的南京军、中国方面，事件另一主角日本海军虽然确实成功地挽救了陆奥号，但在其它方面上的损失却是极其惨重的，首先就是被蒋纬国勒索了11艘军舰，总吨位约有1.9万吨，其次被迫签署了不平等协议，可谓颜面扫地、丧尽尊严，被蒙受了“前所未有的奇耻大辱”，第三是此事件急剧地恶化了本就非常紧张的日本陆海两军的关系。日本陆军上下对海军痛骂声一片，日本海军虽然自知理亏，被骂得灰头土脸，但也进行了理直气壮的反驳，逻辑是现成的：“日本海军为援助日本陆军，这才冒险把战列舰开进本就不利于战列舰作战的长江内河里，结果导致陆奥号陷入存亡悬于一线的巨大危机中，陆军对解救陆奥号没出任何力也没帮上任何忙，结果说这种事后风凉话，简直是岂有此理”。据说，大胜关谈判期间，海军大臣米内大将曾打电话给陆军大臣杉山元大将进行商议，米内大将开门见山地说道：“南京军方面提出了很不利于陆军的要求，海军可能不得不要被迫接受，如果海军拒绝...海军就要失去陆奥号了，不知道...陆军可否对海军进行相对应的赔偿？”他小心翼翼、吞吞吐吐地说出最后这句话。
日本海军应日本陆军要求组建“长江舰队”时，双方曾达成协议：日本陆军拿出日本陆军今年军费的15%转给日本海军以援助日本海军建造大和号和武藏号，如果长江舰队的四艘战列舰在南京战事中“不小心出了事”，日本陆军必须对日本海军进行全额赔偿，同时，日本陆军负责在陆上全力保护这四艘战列舰。
根据这份协议，陆奥号假如被国军蛙人炸了，日本陆军要对日本海军赔钱。赔多少呢？陆奥号差不多价值1.2亿日元。
杉山元大将顿时七窍生烟：“海军无耻！居然要陆军拿出一个多亿的军费！陆军今年军费也就一亿八千多万日元，海军一下子拿走一个多亿，陆军今年还能干什么？陆军在支那战场上还能继续打仗吗？海军到底还要不要脸了？竟想榨干陆军！”（日本军队在1921年至1930年间每年军费基本上都在7亿日元以上，经过伦敦会议和华盛顿会议后，日本开始大规模裁军，军费被削减到每年在5亿日元以下，并且有多位首相想继续削减一个亿的军费，但那几位首相都遭到日本军方激进分子的刺杀或恐吓，所以继续削减一个亿军费的计划没有被实现。此时是1938年初，日本军队今年军费在5亿日元以上，但军费不是陆海军对半分，日本海军素来占军费较大份额，日军军费超过60%是属于海军的，陆军只有百分之三四十。）
被杉山元大将怒斥后，即便米内大将素来是一个好脾气的老实人，也忍不住怒了：“海军为协助陆军可以说是倾其所有！海军现在遇险，陆军却言而无信，翻脸不认账！既然陆军如此薄情寡义，那就不要怪海军了！”
由于日本陆军拒绝赔偿日本海军一个多亿的资金，日本海军才在大胜关谈判中同意了蒋纬国的要求。说白了，蒋纬国提出的那几个要求如果被实现，最吃亏的是日本陆军，日本海军虽然极度不愿意损失陆奥号，但本来也不怎么想“出卖”日本陆军，但日本陆军不愿意补偿日本海军（主要是因为陆奥号实在太昂贵了，日本陆军想赔也赔不起），日本海军索性不管日本陆军的态度以及签署这份协议后会对日本陆军产生什么恶果，破罐子破摔地签署了这份《大胜关协议》。需要注明的是，由于中日两国并未正式互相宣战，所以两国军队此时哪怕已经打得尸山血海，但在政治上也只是“武装冲突”，不算是政治上的“战争”，因此，日本海军与南京军签署暂时性的停战协议是不能算“叛国行为”的，就像1932年初的淞沪抗战，中国海军就与日军签署了“互不开火协议”。当然了，中国海军那时被全国上下骂得狗血淋头，此时的日本海军肯定也一样挨骂，主要是被日本陆军破口大骂。
从常规意义上讲，三大军种里，空军技术性最强，海军其次，陆军最基础，自然而然，日本陆军的“文明程度”大大不如因为技术性更强所以思想更开明、眼光更长远的日本海军，说白了，日本海军可是经常出国的，而日本陆军则只是一群窝在东亚的“土包子”。陆奥号，价值高达一亿多日元，日本海军不可能“饿死事小，失节事大”，况且，日本陆军连十几吨重的铁皮战车都当宝贝，更别说日本海军对陆奥号的珍惜态度了，并且，日本海军在此事上是得到裕仁天皇的默许的。
随着《大胜关协议》被签署，南京战场局势因此而被极大改善，局势不可不谓之大好！三项条件，根据第一项，南京军不会再挨日军主力舰炮击了，根据第二项，德国船只又可以给中国运送军火了，根据第三项，中国海军还顺便捞了一批舰船，已经拼得接近油尽灯枯的中国海军水面舰队得到了一次重要的输血。
一时间，南京卫戍司令部、武汉的军委会大本营、福州的海军司令部内都欢声雷动。
蒋介石（本人）获知此事后大喜过望，心花怒放的他肯定是要好好地嘉奖蒋纬国这个天才儿子的，不过，蒋纬国也不缺什么，他缺的东西蒋介石也没有，搞到最后，蒋介石下令把那艘缴获来的时雨号驱逐舰改名为“纬国号”。
与此同时，日本陆海军内部则是怒火冲天，不但高层互相拍桌对詈，情绪更加激动的中基层军官更是怒火中烧，甚至有红眼的陆军中基层官兵到海军省门口列队举枪、叫骂挑衅，甚至的甚至，还有怒火昏头的陆军中基层官兵决心刺杀海军高层里面“那些胆小如鼠、软弱无能、卑鄙无耻、出卖陆军的卖国贼”，好在日本海军自二二六兵变后已经有了对付陆军的经验，重要场所、重要设施、重要人物都在第一时间被海军陆战队严密保护着。沙袋工事后，铁青着脸的日本海军陆战队官兵与咬牙切齿而来的日本陆军官兵互相拿枪对指，双方随时会擦枪走火。“陆军真要干的话，海军就奉陪到底！”日本陆军的逼迫让日本海军内义愤填膺。本来，日本海军或多或少对签署《大胜关协议》感到几分理亏，对日本陆军产生了几分歉疚，但陆军如此骄横暴戾的态度也让海军忍无可忍了，陆军要求海军“立即废除《大胜关协议》，把更多的战列舰、重型巡洋舰开进长江里，帮助陆军拿下南京，一是尽到自己的责任，二是向陆军进行弥补”，对此，海军肯定不同意。用山本五十六中将的话说，“日本陆海军在‘陆奥号事件’后的关系之恶劣程度已经超过了二二六兵变时，真担心日本军队内会爆发内战”。
最终，这场风波还是靠裕仁天皇亲自出面才勉强压下去。裕仁特地召见了陆海军主要高层首脑，严厉地批评他们“罔顾帝国利益大局，同室操戈、手足相残”，接着，海军按照裕仁的暗示，解除了海军大臣米内光政大将、联合舰队司令长官吉田善吾中将、长江舰队司令官岛田繁太郎中将等多名高级将官的职务，理由是“指挥不当，陷陆奥号于重大危机之中，且让帝国海军蒙受空前耻辱和重大损失”，实际上，解除这些人职务是为了平息陆军的怒火。
日军内部乱成一锅粥的同时，南京城则更加坚不可摧了。
值得一提的是，这起“陆奥号事件”中还有一个细节，就是朝香宫鸠彦王中将的次子音羽正彦。音羽正彦被卜潇等蛙人扣为人质，大胜关谈判时，日方要求释放音羽正彦，遭到蒋纬国的断然拒绝，理由是“一码归一码，我们谈的是陆奥号，跟那个什么音羽正彦没关系”。蒋纬国不傻，知道音羽正彦的价值，所以坚持没松口，最终，音羽正彦被卜潇等蛙人押送到南京城，成了南京军的又一个高级俘虏。
1月7日，日军华中方面军对南京再度展开了一场全面性的攻击。
这场攻击被日本陆军赋予了很强的主观情绪因素，一是恼羞成怒，憎恨南京军搞出了这么一手，逼得日本海军基本上不再直接参加南京战事，二是为了证明“没有海军那帮懦夫，陆军照样可以打仗”，跟海军赌气。
在惊天动地的炮火声和日语嗥叫声中，足足二十万日军被投入攻击，以四面开花之势，沸腾翻涌地席卷向南京城的四面八方，紫金山、龙潭镇、乌龙山、雨花台、大胜关、浦口区...南京城所有外延主阵地全部都遭到日军狂澜恶浪般的强力猛攻。南京军毫无惧色，全力应战，双方杀得天昏地暗、山河变色。南京城四周，杀声如雷、血火如电。
“我自狂歌空度日，飞扬跋扈为谁雄？楚虽三户能亡秦，堂堂中华岂无人？”蒋纬国站在紫金山头陀岭上一边居高临下地观战一边放声长吟，“来得好！来得好！老子求之不得！看看谁死得更多！”
这场战斗完全是硬碰硬，因为双方的最大优势都被削减了。日本海军的战列舰队已是一朝被蛇咬，十年怕井绳，再加上被迫签署了《大胜关协议》，肯定不会再出动重型主力舰参战，顶多出动几艘轻型巡洋舰和驱逐舰“捧个人场”，所以日军地面部队没有强大的舰炮火力援助，只能依靠陆炮，因此炮火力度大减；南京军方面，南京军最强大的就是五座炮山，但五座炮山的山体工事都在日军战列舰队那一个多小时的狂轰滥炸遭到很大损坏，山体内部工事损坏程度较轻，山体表层工事损坏程度较重，三分之二以上的炮位都被摧毁或崩坏塌方，需要大量人力、物力以及时间来慢慢修复，难以居高临下地轰击日军，导致南京军的重火力锐减了一半以上。
红了眼的日军完全是孤注一掷，发疯发狂地展开不计死伤的强攻。当恶战正式爆发时，寒风横扫整个江南，风起云涌、天寒地冻，一场鹅毛大雪猛然间从天而降。
《中华英雄报》报道描述：“...滴水成冰的刺骨寒风中，数量多得一眼望不到头、密密麻麻、浩浩荡荡、犹如蚁群蝗虫般的日军踏着齐膝深的积雪，汇聚成黄色的雪崩，一路咆哮席卷向我军各阵地，我军将士们奋力地炮击、扫射、投掷手榴弹，并在事先埋设了大量地雷以及挖掘了大量陷坑，大雪有力地帮助了我军，地雷只需用白漆涂成白色再放在雪地里即可，都不需要埋在泥土里，至于陷坑，挖好后横上几根芦苇杆再铺上一张草席即可，虽然寒冷让泥土被冻得像石头，挖掘起来十分费事，但官兵们是有办法的。官兵们用大锅烧煮雪水冰块，柴火不成问题，那么多树木被砍了，官兵们柴火足够，烧好开水后泼在地上，融化开冻土层，继而挖掘陷坑。冲锋过来的日军立刻人仰马翻、狼奔豕突，踩中地雷者血肉横飞、打滚哀嚎、踩落陷坑者断骨穿肉、生不如死，中弹者更是四仰八叉地滚滚不断倒地。各阵地前日军尸骸横卧遍野、堆积成山，积雪间尽是横七竖八的日军尸骸和从尸骸体内流淌出的一团团的血泊，日军的污血先是融化开积雪，继而又在寒风中冻成了一滩滩红色的冰块，雪地犹如宣纸洁白，日军的污血则像宣纸上遍地开花的红色墨团，日军的尸体更是冻得僵硬如石，伤兵也被冻死，最后又在炮弹爆炸中被炸得粉碎，各种四分五裂的肢体在气浪中飞舞上空，纷纷扬扬地落下，狼藉不堪、触目惊心。战场原本被积雪覆盖着，一片银装素裹的洁白，就像一张巨大的宣纸，恶战爆发后，黄色的、黑色的、红色的...各种五花八门的颜色在上面疯狂地绽放着，黄色的是日军活人或尸体，黑色的是炮弹炸开的弹坑，红色的是日军的污血或残肢碎肉，光怪陆离、五彩斑斓。寒风过后，雪花纷飞，一切又都被白色给覆盖了，继而再在日军的下一次攻击中重新光怪陆离、五彩斑斓。日军的黄色雪崩如惊涛骇浪撞在坚不可摧的大坝上，我军阵地上持续电闪雷鸣、万箭齐发，无数枪炮发出着震破九霄的密集轰鸣巨响和令人眼花缭乱、目不暇接的风暴火力网，子弹怒射犹如泼风滚雨，形成一道道无法逾越的死亡墙壁，席卷过来的日军成群成片地被打倒，倒在雪地里，堆成黄色的、黑色的、红色的死人沙丘，被雪花覆盖，再被后续日军踩踏上。惊天动地的枪炮声和爆炸声中夹杂着怒发冲冠的汉语吼叫呐喊和撕心裂肺的日语惨叫哀嚎，日军死伤不计其数，但进攻浪潮依然没完没了、波涛汹涌，我军参战官兵们都杀红了眼，很多人都杀得手软了、累得虚脱了甚至瘫倒了。...”
雪虐风饕的战场上，南京军与日军杀得雪白血红、雪冷血热，风雪漫天间，赤火如虹、流光如炬，各主阵地尽皆在疯狂杀戮中癫狂鼎沸。血战中，涌到南京军阵地前的日军完全地被笼罩在南京军的火力网中，因此就地把战死日军冻得像石头的尸体垒成最前沿工事，依靠死尸阵地与南京军展开对射对轰，南京军官兵们同样在战斗间隙时收集日军死尸，堆在阵地缺口上进行堵塞，落下来的炮弹炸得两军阵地上活人死尸一起横飞乱舞，使得这场雪中大战的激烈性和残酷性几乎是举世罕见。
日军的这场强攻足足持续了三天三夜，几乎没有任何间隙，白天疯狂进攻，夜里同样疯狂进攻，战至1月10日傍晚时，日军终于停止了攻击，原因很简单，死伤人数已经超出日军的承受极限，但却没有获得太有价值的战果，不过，在日军停止攻击后，南京军上下则展开反击。“我军一直被动防御，日本人真以为我军只会挨打不成？”第99师师长李玉堂振臂怒吼，厉声高呼，“全体反击！”
南京军实质上的总指挥蒋纬国在征询过众位师长旅长后，得到了压倒性的“全体反击”要求，因为南京军在此战中虽然伤亡也很大，但战斗力没有被太大削弱，同时，官兵们士气沸腾、斗志高昂，日军则损失惨重、师老兵疲，展开反击是符合客观条件的，唯一不足之处就是南京军囤积的弹药已经开始不多了。
“德国的八艘货船已经抵达宁波，其中三艘货船上运载着他们卖给（其实是半卖半送）我们的五千万发供给98k步枪、mp-28冲锋枪、mg-34机枪子弹，预计一周后被运到南京。”在蒋纬国略显犹豫的时候，刘启虎给蒋纬国雪中送炭地送来了这份报告。日本海军不再封锁中国沿海港口（即不攻击来到中国或离开中国的外国船只，但日本海军对中国本国船只还是可以攻击的），使得中德军火贸易再度恢复。抵达宁波的这八艘德国货船实际上早已经到了，一直呆在法国人的越南殖民地金兰湾，没敢进入中国领海，此时自然可以星夜兼程地赶过来。
“既然子弹马上就得到补充，还怕什么！”蒋纬国一拍大腿，“反击！狠狠地打！”
气贯长虹的汉语喊杀声中，南京军对败退的日军展开了全力反击，双方血战了一整夜，到了1月11日上午，战事才正式结束。
此战，南京军光是子弹就耗费了足足四千多万发，但也取得了极大战果，累计毙伤日军超过3.8万人，其中击毙日军超过2.5万人（包括受伤后不治而死的日军伤兵），包括2名少将级旅团长和7名大佐级军官，南京军自身累计伤亡1.27万人，其中阵亡者以及受伤后不治而死者约5000人，战果十分辉煌。在伤亡总数上，南京军和日军的比例大致是1比3，但在死亡总数上，南京军和日军的比例则达到了1比5，这是因为南京军官兵受伤后会迅速被抬下去救治，而倒在战场上的日军伤兵难以得到及时救治，很多日军伤兵都是鲜血流干后在风雪里活生生地冻死的。经过此战，进攻南京的日军的伤亡总数正式突破15万人，其中死亡者约9万人；南京军的伤亡总数约4.8万人，其中死亡者约2万人。
毋庸置疑，南京战至此时还是中国军队掌握着主动权和上风。